2015年9月16日在线发表于《牙科研究杂志》(J Dent Res)的一篇综述总结了口腔微生物组的相关代谢功能。

        分解糖菌：包括链球菌、放线菌和乳酸杆菌等，可通过糖酵解途径将碳水化合物分解为有机酸，且该途径的一些分支途径会导致龋病，同时碱性化反应以及通过精氨酸脱亚胺酶系统的酸中和反应、尿素等，可以抵消酸化作用。

        蛋白水解/氨基酸降解细菌：包括普氏菌和卟啉单胞菌，可将蛋白和多肽分解为氨基酸，再通过特殊途径将氨基酸进一步降解，产生短链脂肪酸、氨和硫化物，以及吲哚/甲基吲哚，这些成分在牙周炎和口气中作为毒力因子和修饰因素发挥作用。

        此外，有研究表明，乙醇衍生物乙醛能引起口腔癌症，而硝酸衍生物亚硝酸盐能预防龋齿并有助于全身健康。微生物代谢活性受口腔环境的影响;然而，微生物代谢也可改变口腔环境，增强细菌的毒力，并引发微生物选择产生具有更强致病性的微生物组。运用代谢组学的方法分析微生物组是提高我们对口腔微生物组功能认识的关键。

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