一是档案管理制度不健全，档案收集率不高。在医院管理中虽然制定了适用于本院的、较为健全的医疗、人事、行政、后勤管理制度，但涉及档案管理的制度却较少。在医院目标管理考核方案中，也很少将档案管理纳入目标考核。同时，由于管理制度不严、不健全，有意无意地不及时移交各科室自己保管的材料，也会造成档案收集不齐全。

　　二是档案内容界定不清，管理范围不明。目前，医院档案管理还没有一整套科学统一的管理制度标准，也没有统一的管理模式，各医院根据自己的理解和实践进行管理，致使许多应该纳入管理的档案被遗漏。

　　三是档案意识不强，利用率较低。由于档案不产生直接的经济效益，医院领导对档案管理意识比较淡薄，“重业务、轻档案”，导致档案信息资源开发不足。

　　四是档案管理分散，完整性和安全性差。医院档案管理一般由设在行政办公室的综合档案室负责，一般只管理文书档案和会计档案，而医疗文书档案等分属各个业务部门管理，在一个单位内形成多了部门管理档案的格局。

　　五是管理人员业务水平不高，档案知识欠缺。目前医院中档案专业出身的人员较少，专业知识老化，知识面较窄等。同时，在医院人才培养中，一般重视医疗技术人员素质的提高和继续教育，对档案管理人员的素质提高没有纳入计划和要求，档案管理人员平时进修学习的机会不够，缺乏系统的档案知识培训，许多档案管理人员的管理水平仍停留在经验上，缺乏创新和活力。

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